Protein–RNA interactions for Protein: P53867

ATG4, Cysteine protease ATG4, yeastyeast

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG4P53867 ECM25YJL201W 1800 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 TIM11YDR322C-A 291 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RPL40AYIL148W 387 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RPS21AYKR057W 264 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RPL32YBL092W 393 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 FLO5YHR211W 3228 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 AIM9YER080W 1884 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 SOK1YDR006C 2706 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RIF1YBR275C 5751 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 VPS64YDR200C 1815 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG4P53867 KAP104YBR017C 2757 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 VAS1YGR094W 3315 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 PAC1YOR269W 1485 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YER121WYER121W 345 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RPL25YOL127W 429 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 TRM7YBR061C 933 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YOR296WYOR296W 3870 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG4P53867 SPB1YCL054W 2526 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 RLF2YPR018W 1821 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 HTL1YCR020W-B 237 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 CDC36YDL165W 576 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YDR344CYDR344C 444 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 DYN2YDR424C 279 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 HSK3YKL138C-A 210 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 TOR1YJR066W 7413 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG4P53867 SPO14YKR031C 5052 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YDR048CYDR048C 315 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YGL041CYGL041C 204 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 AYR1YIL124W 894 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 LCL2YLR104W 396 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 APC2YLR127C 2562 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 PUF6YDR496C 1971 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 PSO2YMR137C 1986 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 DYN1YKR054C 12279 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 CSR2YPR030W 3366 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 ITC1YGL133W 3795 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG4P53867 ASG1YIL130W 2895 nt2.71□□□□□ -1.97
ATG4P53867 YDL062WYDL062W 426 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YDL211CYDL211C 1119 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YGL239CYGL239C 315 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 LSO2YGR169C-A 279 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 TIM13YGR181W 318 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RAM2YKL019W 951 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YME2YMR302C 2553 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 CHO2YGR157W 2610 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RGC1YPR115W 3252 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG4P53867 ALG13YGL047W 609 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG4P53867 COX14YML129C 213 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RPA190YOR341W 4995 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG4P53867 DBP10YDL031W 2988 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG4P53867 HTB2YBL002W 396 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG4P53867 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG4P53867 DBP6YNR038W 1890 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG4P53867 NPR3YHL023C 3441 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YBT1YLL048C 4986 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 QCR7YDR529C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 SMA2YML066C 1110 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 ABF2YMR072W 552 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RPS12YOR369C 432 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 snR49snR49 165 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 BUD4YJR092W 4344 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YCK3YER123W 1575 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 PUF4YGL014W 2667 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 NUM1YDR150W 8247 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YOL057WYOL057W 2136 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RPL23BYER117W 414 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 PHD1YKL043W 1101 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 SDH2YLL041C 801 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 RAD61YDR014W 1944 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 MCD1YDL003W 1701 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 ROG1YGL144C 2058 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 ARP7YPR034W 1434 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG4P53867 DAD3YBR233W-A 285 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG4P53867 PSK2YOL045W 3306 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG4P53867 PSK1YAL017W 4071 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG4P53867 TRM2YKR056W 1920 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG4P53867 YIL102CYIL102C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG4P53867 KAR3YPR141C 2190 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG4P53867 HCS1YKL017C 2052 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 GCD6YDR211W 2139 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YER189WYER189W 369 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 PHS1YJL097W 654 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 IPT1YDR072C 1584 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YJL070CYJL070C 2667 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG4P53867 TOM1YDR457W 9807 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YFH1YDL120W 525 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG4P53867 YIL032CYIL032C 357 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG4P53867 SAR1YPL218W 573 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG4P53867 MDM1YML104C 3384 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG4P53867 HEH2YDR458C 1992 nt2.63□□□□□ -1.99
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