Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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PGGT1BP53609 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PGGT1BP53609 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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PGGT1BP53609 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PGGT1BP53609 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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PGGT1BP53609 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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