Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms