Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPT1P50897 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPT1P50897 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms