Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms