Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK2P49760 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK2P49760 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK2P49760 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK2P49760 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK2P49760 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK2P49760 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms