Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM25P49756 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM25P49756 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM25P49756 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM25P49756 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM25P49756 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM25P49756 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM25P49756 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM25P49756 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM25P49756 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms