Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTBP49356 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms