Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPOP42166 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPOP42166 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPOP42166 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPOP42166 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMPOP42166 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMPOP42166 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPOP42166 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms