Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms