Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 MET6YER091C 2304 nt2.64□□□□□ -1.99
VFA1P40080 SVL3YPL032C 2478 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NUP120YKL057C 3114 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 snR79snR79 84 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 AYR1YIL124W 894 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 RPS18BYML026C 441 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 PRP6YBR055C 2700 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 KSP1YHR082C 3090 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 MSS11YMR164C 2277 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 VPS13YLL040C 9435 nt2.63□□□□□ -1.99
VFA1P40080 MSB1YOR188W 3414 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 SUL1YBR294W 2580 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YJR098CYJR098C 1971 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 SGS1YMR190C 4344 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YPP1YGR198W 2454 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NFT1YKR103W 3657 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 MLH1YMR167W 2310 nt2.62□□□□□ -1.99
VFA1P40080 IPT1YDR072C 1584 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 FKS3YMR306W 5358 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YER121WYER121W 345 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YMR324CYMR324C 243 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 LSM7YNL147W 348 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NAB6YML117W 3405 nt2.61□□□□□ -1.99
VFA1P40080 MPH1YIR002C 2982 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NUM1YDR150W 8247 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 HRD3YLR207W 2502 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 MZM1YDR493W 372 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 PAU14YIL176C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YJL202CYJL202C 348 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 PAU1YJL223C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 EMC6YLL014W 327 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 CRS5YOR031W 210 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 RSN1YMR266W 2862 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YJL070CYJL070C 2667 nt2.6□□□□□ -1.99
VFA1P40080 UBP11YKR098C 2154 nt2.59□□□□□ -1.99
VFA1P40080 RPL40BYKR094C 387 nt2.59□□□□□ -1.99
VFA1P40080 CGI121YML036W 546 nt2.59□□□□□ -1.99
VFA1P40080 YNL010WYNL010W 726 nt2.59□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NEW1YPL226W 3591 nt2.59□□□□□ -1.99
VFA1P40080 NAN1YPL126W 2691 nt2.59□□□□□ -2
VFA1P40080 PTC5YOR090C 1719 nt2.59□□□□□ -2
VFA1P40080 YIL080WYIL080W 4722 nt2.59□□□□□ -2
VFA1P40080 REV1YOR346W 2958 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 YJR003CYJR003C 1560 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 NCL1YBL024W 2055 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 FCF2YLR051C 654 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 VTI1YMR197C 654 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 YNL146WYNL146W 303 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 UTP14YML093W 2700 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 RLI1YDR091C 1827 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 OSW7YFR039C 1533 nt2.58□□□□□ -2
VFA1P40080 ESC1YMR219W 4977 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 YFR056CYFR056C 369 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 GRX8YLR364W 330 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 PRK1YIL095W 2433 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 YBT1YLL048C 4986 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 SMC6YLR383W 3345 nt2.57□□□□□ -2
VFA1P40080 PDR3YBL005W 2931 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 TMN3YER113C 2121 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 BNR1YIL159W 4128 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 GEA1YJR031C 4227 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 MMS1YPR164W 4224 nt2.56□□□□□ -2
VFA1P40080 SPF1YEL031W 3648 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 ACB1YGR037C 264 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 LSO2YGR169C-A 279 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 UTP30YKR060W 825 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 YBL108WYBL108W 306 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 YPR146CYPR146C 330 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 YSY6YBR162W-A 198 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 SCD5YOR329C 2619 nt2.55□□□□□ -2
VFA1P40080 FRE2YKL220C 2136 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 YEF3YLR249W 3135 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 SHE2YKL130C 741 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 RPL9BYNL067W 576 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 RTC6YPL183W-A 282 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 YPL225WYPL225W 441 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 VPS16YPL045W 2397 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 KAR3YPR141C 2190 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 INP51YIL002C 2841 nt2.54□□□□□ -2
VFA1P40080 MRPL31YKL138C 396 nt2.53□□□□□ -2
VFA1P40080 RPS1AYLR441C 768 nt2.53□□□□□ -2
VFA1P40080 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.53□□□□□ -2
VFA1P40080 snR43snR43 209 nt2.53□□□□□ -2
VFA1P40080 SNU114YKL173W 3027 nt2.53□□□□□ -2
VFA1P40080 INP53YOR109W 3324 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 RRP12YPL012W 3687 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 YDL011CYDL011C 324 nt2.52□□□□□ -2.01
VFA1P40080 FMP16YDR070C 282 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.8 ms