Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF4A3P38919 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms