Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GGCXP38435 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms