Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC25CP30307 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC25CP30307 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms