Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NMBRP28336 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMBRP28336 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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