Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
PSMB4P28070 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms