Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IL3RAP26951 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms