Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms