Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMLP26374 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMLP26374 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMLP26374 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMLP26374 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms