Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKCHP24723 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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