Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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