Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms