Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRF1P14222 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRF1P14222 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRF1P14222 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRF1P14222 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRF1P14222 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRF1P14222 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRF1P14222 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRF1P14222 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRF1P14222 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms