Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CFTRP13569 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CFTRP13569 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFTRP13569 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFTRP13569 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFTRP13569 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFTRP13569 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFTRP13569 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFTRP13569 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFTRP13569 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFTRP13569 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFTRP13569 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFTRP13569 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFTRP13569 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFTRP13569 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFTRP13569 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFTRP13569 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFTRP13569 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFTRP13569 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFTRP13569 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms