Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN1P12814 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms