Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP2CP0DJJ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms