Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYCNP04198 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYCNP04198 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCNP04198 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms