Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDHAP00338 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDHAP00338 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDHAP00338 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDHAP00338 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDHAP00338 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDHAP00338 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms