Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1O95476 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1O95476 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms