Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBF1O95248 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SBF1O95248 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBF1O95248 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBF1O95248 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBF1O95248 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBF1O95248 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms