Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG12O94817 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG12O94817 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms