Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms