Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms