Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F6O75461 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F6O75461 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F6O75461 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms