Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms