Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM4AO75164 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms