Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP104O60308 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP104O60308 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP104O60308 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP104O60308 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP104O60308 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP104O60308 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms