Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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VEGFDO43915 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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VEGFDO43915 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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