Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF6O14896 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF6O14896 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF6O14896 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF6O14896 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF6O14896 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF6O14896 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF6O14896 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF6O14896 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF6O14896 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms