Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCER2I3L3R5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCER2I3L3R5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms