Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms