Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms