Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP27XA6NNY8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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