Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJR5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJR5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJR5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJR5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms