Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBFOX3A6NFN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBFOX3A6NFN3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms