Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF316A6NFI3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms