Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SSPOA2VEC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms