Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms