Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IL24-202ENST00000367093 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CD200-203ENST00000473539 1524 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SKP22-201ENST00000365097 293 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FRG1JP-201ENST00000376334 931 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TRBV23OR9-2-201ENST00000390389 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MAP3K7CL-205ENST00000399926 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TPM3P4-201ENST00000425942 755 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC244205.2-201ENST00000434790 898 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC010967.3-201ENST00000438648 213 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RPL12P44-201ENST00000442319 502 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PSPC1P1-201ENST00000442352 665 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL669831.5-219ENST00000443772 417 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL662789.1-201ENST00000448198 724 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP000266.1-201ENST00000450936 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ARAFP3-201ENST00000454154 490 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RPL12P21-201ENST00000472214 518 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SL280P-201ENST00000496490 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GPN1-209ENST00000503738 984 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RAB5CP2-201ENST00000505368 637 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC027698.1-201ENST00000518536 625 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC005841.1-201ENST00000547042 287 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC023511.1-201ENST00000549055 571 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL022318.2-201ENST00000558766 258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SSH2-209ENST00000579954 428 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01764-201ENST00000587970 380 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01926-201ENST00000589476 478 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 C5orf58-206ENST00000593851 509 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PCDH18-206ENST00000611581 819 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ADAM2-205ENST00000521880 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ATP6V1C1-203ENST00000518857 1501 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MIR3976HG-202ENST00000566533 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR7G3-201ENST00000305444 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DUSP21-201ENST00000339042 885 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CD160-203ENST00000401557 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZFY-AS1-201ENST00000417305 500 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FAM213AP1-201ENST00000418757 668 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC016027.1-201ENST00000426483 805 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FABP5P10-201ENST00000435729 408 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL365356.2-201ENST00000441526 196 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MTND6P21-201ENST00000443620 482 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC003666.1-201ENST00000454113 611 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SL35P-201ENST00000466169 292 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RN7SL698P-201ENST00000480095 302 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC092943.1-201ENST00000485389 878 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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