Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 C2orf76-204ENST00000409877 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL121999.1-201ENST00000420156 332 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ELOA-AS1-201ENST00000427796 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SPAG11A-205ENST00000434307 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC01006-205ENST00000440711 336 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 Z69666.1-201ENST00000445733 801 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MYL6P1-201ENST00000449877 453 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PIGA-205ENST00000482148 1092 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL316P-201ENST00000483452 272 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 HNRNPA1P20-201ENST00000484852 955 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC017013.1-201ENST00000506459 799 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MRPS27-207ENST00000515404 1183 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC022730.3-201ENST00000521051 736 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PGA4-202ENST00000537932 840 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PGA3-204ENST00000538258 867 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PGA3-207ENST00000543125 968 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PGA4-206ENST00000544899 867 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SLC25A3P2-201ENST00000547720 880 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL321P-201ENST00000581742 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL220P-201ENST00000581978 300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC005498.2-201ENST00000590579 326 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP001469.1-202ENST00000626933 695 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 DBIL5P2-202ENST00000491724 1692 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC02436-202ENST00000509017 2186 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KCNIP1-209ENST00000616807 1448 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TAC1-202ENST00000346867 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 LINC00475-206ENST00000434944 796 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 AC034102.4-201ENST00000548595 434 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC01764-202ENST00000589310 441 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SMIM7-214ENST00000597711 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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